
Celem naszych badań jest zrozumienie mechanizmów fizycznych leżących u podstaw funkcjonowania układów biomolekularnych. Chcemy odpowiedzieć na pytanie w jaki sposób struktura makromolekuł determinuje ich właściwości dynamiczne i w jaki sposób dynamika przekłada się na zdolność do pełnienia określonej roli w żywej komórce. W naszej pracy posługujemy się symulacjami komputerowymi, metodami fizyki statystycznej, technikami bioinformatycznymi oraz narzędziami analizy danych.
W obecnej chwili skupiamy się na:
– badaniu roli zlokalizowanych cząsteczek wody w strukturach kinaz białkowych,
– badaniu oddziaływania peptydu fuzyjnego wirusa grypy z błoną lipidową,
– rozwijaniu metod opisu hydratacji makromolekuł.
Realizowane projekty
– Efekty hydratacyjne w kinazach białkowych (Sonata, NCN)
– Embo Installation Grant

telefon: +48 22 55 43660
pokój: 04.06
www: http://setnylab.dev.dev.cent.uw.edu.pl
dr Piotr Setny
PhD students:
mgr Anita Dudek
mgr Marcin Sobieraj
mgr Marta Dorota Wiśniewska
Alumni:
XX xxx
Setny, P., & Wiśniewska, M. D. (2018)
A. Proceedings of the National Academy of Sciences, 115(15), 3852-3857
Worch, R., Dudek, A., Krupa, J., Szymaniec, A., & Setny, P. (2018)
International journal of molecular sciences, 19(2), 578
Worch, R., Krupa, J., Filipek, A., Szymaniec, A., & Setny, P. (2017).
Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-General Subjects, 1861(2), 97-105.
Setny, P., & Dudek, A. (2017).
Journal of chemical theory and computation, 13(6), 2762-2776.
Weiß, R. G., Setny, P., & Dzubiella, J. (2017).
Journal of chemical theory and computation, 13(6), 3012-3019.
Peccati, F., Wiśniewska, M., Solans-Monfort, X., & Sodupe, M. (2016).
Physical Chemistry Chemical Physics, 18(17), 11634-11643.
Kulik, M., & Trylska, J. (2016).
RAIRO-Operations Research, 50(2), 375-386.
Weiß, R. G., Setny, P., & Dzubiella, J. (2016).
The Journal of Physical Chemistry B, 120(33), 8127-8136.
Setny, P. (2015)
J. Chem. Theory Comput, 11(12), 5961-5972
Setny, P. (2015).
The Journal of Physical Chemistry B, 119(19), 5970-5978.
Setny, P. (2015)
The Journal of Physical Chemistry B, 119(19), 5970-5978.
Setny, P., & Zacharias, M. (2013).
Journal of chemical theory and computation, 9(12), 5460-5470.
Aktualnie brak nowych ofert pracy |
to jest tekst dodatkowy